Sekretariatet varetager den daglige drift af LOKK. Det organiserer faglige seminarer og temadage for medlemmerne og fundraiser og administrerer projekter til gavn for voldsudsatte kvinder og børn på kvindekrisecentre. Sekretariatet indsamler også dokumentation og viden om partnervold og arbejder for at skabe de bedste rammer for krisecentre, der er en del af LOKK.